Сефирот с самого рождения имел серьёзные проблемы. Его отцом был безумный психопат-учёный по имени Ходжо, который, перед рождением Сефирота, насильно инфицировал его мать, Лукрецию (с которой Ходжо работал над проектом Cetra) клетками враждебного инопланетного существа JENOVA. В результате этого эксперимента и появился на свет Сефирот, изначально имея нечеловеческую силу в своём распоряжении.

Благодаря своей неограниченной жизненной энергии, Сефирот вырос в отважного лидера и легендарного воина, но в определённый момент его гены дали слабину. И необратимое безумие всё же настигло Сефирота после того, как он узнал, что его генеалогической "матерью" является JENOVA - лишённое интеллекта существо, созданное только для того, чтобы пожирать потоки жизненной силы планеты. После этого, Сефирот стал просто маньяком планетарных масштабов, не имеющим определённых мотивов и озабоченным только идеей уничтожения. Уничтожения всего живого на планете...